海南省農業科學院組建于1989年，是省政府直屬科研事業單位。下設9個專業研究所（室）和4家科技型企業；擁有國家水稻改良中心海口分中心、國家農產品加工技術研發中心熱帶水果加工專業分中心、國家農作物品種區域試驗站、星火培訓基地、國家五指山豬重點資源保種場、海南省（）原種場，以及6個國家現代農業產業體系綜合試驗站、5個農業部野外科學觀測試驗站、3個省級重點實驗室、3個省級工程技術研究中心、1個博士后科研流動工作站等，是農業部農藥登記田間藥效試驗認證單位。
建院以來，已承擔國家、省部級項目750多項、國際合作項目30多項，有400多個項目通過部省級成果鑒定、驗收或審定，148項獲得省部級科技成果獎勵。其中2005年以來獲得省部級以上科技進步、成果轉化獎的科技成果有84項，獲省部級特等獎3項、一等獎22項、二等獎23項、三等獎36項。先后編寫出版了瓜菜、熱帶水果、畜牧、水稻、熱帶花卉等海南熱帶高效農業栽培技術系列叢書、瓜菜病蟲害綜合防治技術和果樹、蔬菜等農產品標準化、生產技術規程等培訓教材共40多種，100多萬冊，推廣優良新品種、新技術600余項，累計推廣面積5000多萬畝。示范推廣的瓜菜新品種約占全省冬季瓜菜播種面積的59%，水稻新品種約占全省水稻播種面積的70%；在熱帶水果新品種引進示范推廣，農作物病蟲害防治和環境保護，海南地方豬、文昌雞、東山羊、五指山豬的研究推廣和測土配方施肥等方面，也做了大量卓有成效的工作，為滿足海南農業結構調整，促進農業增效、農民增收以及海南熱帶現代農業發展做出了重要貢獻。
發展定位：從事農業科技創新、科技成果轉化、推廣與服務的綜合性、公益性農業科研機構，是推動海南農業科技進步的骨干力量和實施科技興農戰略的主力科技團隊；為解決制約我省熱帶現代農業發展的重大科技難題提供科技支撐和智力支持；是省委省政府研究制定農業發展戰略、實施宏觀決策的參謀助手。
發展目標：以構建海南農業科技創新、成果轉化和科技服務三大體系，解決制約海南熱帶現代農業發展的重大科技難題為主要目標，努力構建特色明顯，管理，綜合科技實力位居國內前列，在東盟各國及熱帶地區具有一定影響、能滿足我省熱帶特色現代農業科技需求的綜合性農業科學院。
發展思路：以科學發展觀為指導，堅持“科研立院、服務強院、人才興院、開放辦院”的發展理念，緊緊圍繞海南社會主義新農村建設和解決“三農”問題的需求，以人才隊伍建設、科技創新能力建設為核心，不斷深化科技體制改革，全面提升科技實力和科技競爭力，加快科技成果、實用技術轉化與推廣步伐，努力實現農科院跨越式發展，推動我省農業經濟高效、協調、可持續發展。